锦织圭与拉斐尔·纳达尔共交手12次，其中锦织圭取得了3胜9负的成绩。这12场比赛分别发生在不同的城市和球场。

第一场比赛于2008年1月17日在澳大利亚墨尔本公园举行，锦织圭以6-4、6-2、6-4战胜了纳达尔。锦织圭采用了快速的底线抽击和积极的网前截击战术，而纳达尔则主要依赖其稳定的发球和底线相持能力。锦织圭当时由锦织圭和西恩·阿加西组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第二场比赛发生在2009年6月28日的法国网球公开赛第三轮，锦织圭以7-6(7-4)、6-3、6-3战胜了纳达尔。锦织圭在比赛中采取了更为灵活的移动和快速的进攻策略，而纳达尔则在比赛中显得有些疲软，未能发挥出其通常水平。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第三场比赛是2011年6月12日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛第四轮，锦织圭以7-6(7-3)、6-4、6-3再次战胜了纳达尔。锦织圭在这场比赛中表现得更加自信和坚定，而纳达尔则在关键时刻出现了失误。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第四场比赛是2011年10月16日在意大利都灵举行的ATP1000大师赛半决赛，纳达尔以7-6(7-4)、6-3、6-4战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中采用了稳健的防守反击战术，并且在关键时刻表现出色。锦织圭在这场比赛中尽管尝试了多拍对攻，但未能成功突破纳达尔的防线。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第五场比赛是2012年6月10日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛四分之一决赛，纳达尔以6-3、6-4、6-2战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展现了强大的发球和底线控制能力，而锦织圭则未能有效地应对纳达尔的攻击。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第六场比赛是2013年6月12日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛半决赛，纳达尔以6-3、6-4、6-3战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中保持了高水平的表现，而锦织圭则未能找到有效的应对策略。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第七场比赛是2013年10月13日在意大利都灵举行的ATP1000大师赛半决赛，纳达尔以6-4、6-3、6-4战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展示了出色的发球和底线技术，而锦织圭则未能有效突破纳达尔的防线。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第八场比赛是2014年6月14日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛半决赛，纳达尔以6-4、6-4、6-4战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展现了强大的发球和底线控制能力，而锦织圭则未能有效应对纳达尔的攻击。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第九场比赛是2014年10月12日在意大利都灵举行的ATP1000大师赛半决赛，纳达尔以6-4、6-3、6-4战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展示了出色的发球和底线技术，而锦织圭则未能有效突破纳达尔的防线。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第十场比赛是2015年6月13日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛半决赛，纳达尔以6-3、6-4、6-4战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展现了强大的发球和底线控制能力，而锦织圭则未能有效应对纳达尔的攻击。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第十一场比赛是2016年6月11日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛半决赛，纳达尔以6-3、6-3、6-3战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展现了出色的发球和底线技术，而锦织圭则未能有效突破纳达尔的防线。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。

第十二场比赛是2017年6月11日在法国巴黎罗兰·加洛斯举行的法国网球公开赛半决赛，纳达尔以6-3、6-3、6-3战胜了锦织圭。纳达尔在这场比赛中展现了强大的发球和底线控制能力，而锦织圭则未能有效应对纳达尔的攻击。锦织圭当时由锦织圭和杉田佑一组成双打组合，但单打比赛中，锦织圭独力出战。